福建医科大学的校徽上，中文校名是由书法家舒同手写的，为他独特的舒体。

　　校标图案主体由字母“M”、蛇杖和阿拉伯数字“1937”等元素组合构成。

　　蛇杖的造型，形似DNA双螺旋结构，代表现代医学。

　　字母M取自汉语拼音“Mǐn（闽）”和英文“Medical（医学）”首个字母，又像是打开的书籍，代表高等教育。

　　而整体造型就像是汉字“闽”，为福建的简称，代表了学校的所在地；1937则是创校年份。