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AI分析蛋白结构 动态追踪病毒变异

2020-02-20 04:24:27大公报
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  图:杭州杰毅生物开发了全自动高通量测序建库仪/网络图片

  近日,浙江省疾控中心上线自动化的全基因组检测分析平台,利用阿里达摩院研发的AI算法,将原来数小时的疑似病例基因分析缩短至半小时,并能精準检测出病毒的变异情况。

  “目前,主流检测手段为核酸检测方法。”达摩院算法专家顾斐博士指出,这项技术实际检测时间相对较长,而且只能检测到病毒基因的局部。由於病毒存在变异可能,因此核酸检测可能会出现假阴性、假阳性的情况。

  把关后期防疫 提升确诊效率

  不同於核酸检测,新的分析平台是对样本进行全基因组序列分析比对,能够有效防止漏检。此外,平台有效缩短了全基因测序的时间。“越往后走,越需要全基因检测,因为后期防疫的核心是防止病毒变异。”顾斐说。

  顾斐介绍,在整个平台中,合作夥伴杰毅生物开发了全自动高通量测序建库仪,把常规人工需要12小时的工作缩短到2个小时。

  “每次测序过程中产生的海量基因数据,则交由达摩院AI算法进行分析。”顾斐说,他们将病毒基因分析的速度由数小时缩短到半小时。同时,病毒序列拼接的速度由30分鐘-1小时缩短到15-30分鐘。

  由此,AI算法可以在15-30分鐘内预测病毒蛋白二级结构,从而帮助医护人员检测到病毒全貌,使得变异的病毒也能精準检测,大幅提升确诊效率。

  记者 俞昼

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