港区国安法草案说明指出，行政长官可以指定若干法官审理涉及危害国家安全的案件。律政司司长郑若骅昨日表示，以她对港区国安法草案说明去理解，行政长官会列出负责处理国安案件的一批法官名单。而基本法规定行政长官有法官任命权，行政长官指定若干法官负责处理危害国家安全犯罪案件的做法，不会影响司法独立。

郑若骅举例指，香港有商事法庭、仲裁法庭，司法机构已经挑选出一个法官名单，由他们去优先处理这些案件，因为这些法官会更擅长，案例也会写得更加清晰。

港区国安法草案的附则写明，“香港特别行政区本地法律与本法不一致的，适用本法规定;本法的解释权属於全国人民代表大会常务委员会。”郑若骅认为，其实宪法与基本法是宪制的重要原则，而这条全国性法律其实是按宪法及基本法相关原则去作出，所以当全国人大常委会立法时，其实是要依照基本法相关条文，符合基本法要求。

郑若骅又表示，律政司会设立专门处理危害国家安全犯罪案件的检控部门，而处理危害国家安全的案件，中央官员已提及绝大多数的案件都是在香港处理。“说明亦提及除了一些特定情形外，这些我相信是极少极少数的情况。”