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科大研发基因测序新技术 揭开癌细胞假面具

2023-02-03 04:23:53大公报
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  图:由科大团队开发的新技术scONE-seq,为未来开发治癌药物及药物靶标开辟新方向。\科大供图

  【大公报讯】人类对癌症所知有限,透过分析DNA和RNA测序所产生的肿瘤分子数据,或能为肿瘤复发等谜团提供更多线索。香港科技大学研究人员研发一种可为冷冻和新鲜细胞组织样本同时进行单细胞DNA和RNA测序的新技术,更利用这方法识别出伪装为正常细胞的罕见脑肿瘤细胞“间谍”,即星形胶质瘤患者样本中的一种细小而独特的肿瘤细胞亚群。是次发现为一些最复杂和罕见肿瘤的研究带来突破,并为未来的药物靶标发现开辟新方向。该研究最近于《科学进展》上发表。

  肿瘤内的不同细胞基因和分子构造,会影响癌症的病理以及肿瘤产生耐药性的能力。因此在决定癌症治疗方法前进行DNA和RNA测序,可以取得有关肿瘤基因和分子组成的重要资讯。

  目前,大部分现成的临床癌症样本是来自冷冻生物样本库的冷冻组织,这些样本可用于肿瘤单细胞RNA测序分析。但利用现有技术对这些冷冻组织同时进行单细胞DNA和RNA测序仍有一定的局限。

    “间谍”细胞具耐药性

  由科大生命科学学部及化学与生物工程学系副教授吴若昊及其博士后研究员于雷带领的团队,开发了一种新型多功能单细胞多组学分析技术scONE-seq。这种技术不仅能分析冷冻细胞及难以取得的细胞类型,如骨骼和大脑;同时也大大简化了收集肿瘤中DNA和RNA数据的实验流程。

  星形胶质瘤是一种致命且具扩散性的脑肿瘤,患者在确诊后五年内的存活率仅约5%。团队利用其新型单细胞技术,在患者样本中发现了一种细小而独特的肿瘤细胞亚群。

  研究团队指出,这种独特的肿瘤细胞群体通过伪装成大脑的正常星形胶质细胞,逃过使用其他常见肿瘤测序方法的检测。此外,团队亦发现这种“间谍”肿瘤细胞具有耐药性分子特征,而其在肿瘤恶化中所起的作用,将是未来研究的重要方向。

  吴若昊说,scONE-seq方法可以识别以前未能探测到、但导致对治疗没有反应的罕见肿瘤细胞,提供一个有助开发药物靶点和药物的新方向。

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