据中央社报道，新条文明定，涉及重大政治影响的政治议题之协议，“行政院”应在协商开始90日前，向立院提出评估报告，经立院审议通过后，始得开启协商；负责协议机关提出缔结计劃，经全体立委3/4出席，及出席委员3/4同意，才能开启协商。

　　“双审议”门槛极高

　　条文明定，负责协议的机关应依照缔结计劃进行谈判协商，并适时向立院报告；若立院判断双方已无法依缔结计劃进行时，得经全体立委1/2以上决议，要求终止协商；“行政院”判断双方谈判协商已无法依缔结计劃进行时，应终止协商，并向立院报告。

　　条文明定，待完成谈判协商后，应在15日内报请领导人核定，核定后15日内“行政院”应公开协议草案完整内容，函送立院审议，报告协议过程并再次评估，立院应举行听证。

　　条文明定，协议草案经全体立委3/4出席，及出席委员3/4同意，再由“中选会”办理“公投”，且获有效同意票超过投票权人总额之半数者，即为协议草案通过。

　　条文还明定，“主权国家地位与自由民主宪政秩序之毁弃或变更，不得作为政治议题谈判及协议项目”。

　　岛内中国文化大学教授邱毅向大公报表示，台“立法院”大幅提高两岸签署政治协议的门坎，严格来说，已成为“两岸不签署政治协议”的法律案，今后两岸恐怕难以签署政治协议，包括和平协议、军事互信机制。

　　台湾竞争力论坛理事长庞建国教授表示，一方面是因为蔡英文施政绩效不佳，面对选举拿不出政绩，就想用升高两岸敌意的方式来转移焦点；另外一方面，是“台独”人士面对两岸消长越来越明显，心虚害怕，就要阻挠两岸之间的融合发展大趋势。