检察机关在审查起诉阶段依法告知了被告人钟自然享有的诉讼权利,并讯问了被告人钟自然,听取了辩护人的意见。检察机关起诉指控:被告人钟自然利用担任中国地质调查局党组副书记、副局长,原国土资源部总工程师,原国土资源部党组成员,自然资源部党组成员,中国地质调查局党组书记、局长等职务上的便利,以及职权或者地位形成的便利条件,为他人谋取利益,非法收受他人财物,数额特别巨大;钟自然违反保守国家秘密法的规定,故意泄露国家秘密,情节严重,依法应当以受贿罪、故意泄露国家秘密罪追究其刑事责任。